Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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