Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNH2Q12809 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNH2Q12809 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms