Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms