Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LOXL1Q08397 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms