Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms