Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP27A1Q02318 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms