Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IP78347 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms