Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RPS29P62273 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
RPS29P62273 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
RPS29P62273 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RPS29P62273 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RPS29P62273 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RPS29P62273 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
RPS29P62273 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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