Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00313P59037 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms