Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GFRA1P56159 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms