Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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PGGT1BP53609 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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PGGT1BP53609 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGGT1BP53609 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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