Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP98P52948 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP98P52948 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP98P52948 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP98P52948 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP98P52948 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP98P52948 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP98P52948 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP98P52948 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP98P52948 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP98P52948 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP98P52948 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP98P52948 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP98P52948 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP98P52948 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP98P52948 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP98P52948 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP98P52948 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP98P52948 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP98P52948 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP98P52948 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP98P52948 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP98P52948 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP98P52948 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP98P52948 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP98P52948 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP98P52948 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP98P52948 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP98P52948 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP98P52948 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP98P52948 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP98P52948 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP98P52948 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP98P52948 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP98P52948 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP98P52948 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP98P52948 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP98P52948 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP98P52948 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP98P52948 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP98P52948 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP98P52948 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP98P52948 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP98P52948 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP98P52948 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP98P52948 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP98P52948 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP98P52948 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP98P52948 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP98P52948 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP98P52948 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP98P52948 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP98P52948 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP98P52948 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP98P52948 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP98P52948 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP98P52948 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP98P52948 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP98P52948 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP98P52948 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP98P52948 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP98P52948 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP98P52948 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP98P52948 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP98P52948 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP98P52948 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP98P52948 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms