Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC3P51654 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC3P51654 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC3P51654 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC3P51654 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC3P51654 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC3P51654 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC3P51654 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC3P51654 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC3P51654 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC3P51654 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC3P51654 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC3P51654 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC3P51654 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC3P51654 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC3P51654 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC3P51654 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC3P51654 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GPC3P51654 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GPC3P51654 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPC3P51654 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPC3P51654 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC3P51654 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC3P51654 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC3P51654 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC3P51654 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC3P51654 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC3P51654 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC3P51654 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC3P51654 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC3P51654 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC3P51654 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC3P51654 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC3P51654 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC3P51654 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC3P51654 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC3P51654 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC3P51654 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC3P51654 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC3P51654 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC3P51654 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC3P51654 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC3P51654 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPC3P51654 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms