Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAMP50895 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAMP50895 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAMP50895 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BCAMP50895 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BCAMP50895 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BCAMP50895 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAMP50895 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAMP50895 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAMP50895 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAMP50895 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAMP50895 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAMP50895 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAMP50895 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAMP50895 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAMP50895 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAMP50895 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAMP50895 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAMP50895 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAMP50895 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAMP50895 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAMP50895 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAMP50895 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAMP50895 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAMP50895 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAMP50895 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAMP50895 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAMP50895 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAMP50895 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAMP50895 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAMP50895 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAMP50895 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAMP50895 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAMP50895 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAMP50895 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAMP50895 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAMP50895 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAMP50895 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAMP50895 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAMP50895 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAMP50895 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAMP50895 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAMP50895 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAMP50895 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAMP50895 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAMP50895 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAMP50895 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAMP50895 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAMP50895 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAMP50895 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCAMP50895 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCAMP50895 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms