Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD2P49005 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
POLD2P49005 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD2P49005 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD2P49005 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD2P49005 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms