Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAD52P43351 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAD52P43351 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAD52P43351 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms