Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSSP25774 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSSP25774 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSSP25774 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSSP25774 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSSP25774 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSSP25774 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSSP25774 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSSP25774 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSSP25774 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSSP25774 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSSP25774 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSSP25774 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSSP25774 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSSP25774 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSSP25774 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSSP25774 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSSP25774 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSSP25774 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms