Protein–RNA interactions for Protein: P21741

MDK, Midkine, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDKP21741 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MDKP21741 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDKP21741 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDKP21741 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms