Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms