Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN1P12814 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN1P12814 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms