Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MMP3P08254 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MMP3P08254 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MMP3P08254 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MMP3P08254 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MMP3P08254 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MMP3P08254 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MMP3P08254 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MMP3P08254 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MMP3P08254 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MMP3P08254 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MMP3P08254 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MMP3P08254 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MMP3P08254 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MMP3P08254 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MMP3P08254 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MMP3P08254 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MMP3P08254 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MMP3P08254 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MMP3P08254 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MMP3P08254 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MMP3P08254 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MMP3P08254 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MMP3P08254 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MMP3P08254 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MMP3P08254 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MMP3P08254 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MMP3P08254 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MMP3P08254 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MMP3P08254 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MMP3P08254 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MMP3P08254 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MMP3P08254 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MMP3P08254 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MMP3P08254 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MMP3P08254 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MMP3P08254 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MMP3P08254 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MMP3P08254 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MMP3P08254 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MMP3P08254 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MMP3P08254 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MMP3P08254 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MMP3P08254 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MMP3P08254 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MMP3P08254 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MMP3P08254 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MMP3P08254 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MMP3P08254 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MMP3P08254 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MMP3P08254 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MMP3P08254 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MMP3P08254 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MMP3P08254 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MMP3P08254 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MMP3P08254 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MMP3P08254 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MMP3P08254 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MMP3P08254 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MMP3P08254 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MMP3P08254 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MMP3P08254 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MMP3P08254 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MMP3P08254 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MMP3P08254 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MMP3P08254 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MMP3P08254 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MMP3P08254 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MMP3P08254 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MMP3P08254 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MMP3P08254 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MMP3P08254 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MMP3P08254 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MMP3P08254 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MMP3P08254 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MMP3P08254 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MMP3P08254 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MMP3P08254 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MMP3P08254 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MMP3P08254 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MMP3P08254 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MMP3P08254 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MMP3P08254 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MMP3P08254 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MMP3P08254 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MMP3P08254 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MMP3P08254 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MMP3P08254 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MMP3P08254 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MMP3P08254 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MMP3P08254 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MMP3P08254 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MMP3P08254 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MMP3P08254 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MMP3P08254 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MMP3P08254 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MMP3P08254 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MMP3P08254 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MMP3P08254 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MMP3P08254 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms