Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms