Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG12O94817 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG12O94817 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG12O94817 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms