Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F6O75461 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F6O75461 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms