Protein–RNA interactions for Protein: O60542

PSPN, Persephin, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPNO60542 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSPNO60542 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSPNO60542 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPNO60542 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPNO60542 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPNO60542 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPNO60542 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPNO60542 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPNO60542 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPNO60542 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPNO60542 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPNO60542 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPNO60542 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPNO60542 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPNO60542 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPNO60542 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPNO60542 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms