Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLOCKO15516 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms