Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACOD1A6NK06 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms