Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT87PA6NCN2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms