Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF13BQ9Y275 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFSF13BQ9Y275 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFSF13BQ9Y275 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFSF13BQ9Y275 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFSF13BQ9Y275 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF13BQ9Y275 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF13BQ9Y275 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF13BQ9Y275 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF13BQ9Y275 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF13BQ9Y275 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF13BQ9Y275 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF13BQ9Y275 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF13BQ9Y275 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF13BQ9Y275 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF13BQ9Y275 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF13BQ9Y275 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF13BQ9Y275 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms