Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN1Q9ULB1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN1Q9ULB1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms