Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMPXQ9UHP9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMPXQ9UHP9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms