Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4Q9P0V3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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