Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV39

PRR34, Proline-rich protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR34Q9NV39 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PRR34Q9NV39 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms