Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GINM1Q9NU53 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GINM1Q9NU53 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms