Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms