Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms