Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms