Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9BQ9NP90 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms