Protein–RNA interactions for Protein: Q9H999

PANK3, Pantothenate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK3Q9H999 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PANK3Q9H999 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PANK3Q9H999 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PANK3Q9H999 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PANK3Q9H999 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PANK3Q9H999 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PANK3Q9H999 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PANK3Q9H999 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PANK3Q9H999 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PANK3Q9H999 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PANK3Q9H999 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PANK3Q9H999 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PANK3Q9H999 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PANK3Q9H999 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PANK3Q9H999 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms