Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM8Q9BZR9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms