Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC4A5Q9BY07 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms