Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIRIP3Q9BW71 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIRIP3Q9BW71 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms