Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms