Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FYCO1Q9BQS8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FYCO1Q9BQS8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms