Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIN3AQ96ST3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms