Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms