Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNFT2Q96EX2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms