Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf62Q8N4C0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf62Q8N4C0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms