Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPAP2Q8IXW5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms