Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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RAB11FIP4Q86YS3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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RAB11FIP4Q86YS3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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RAB11FIP4Q86YS3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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RAB11FIP4Q86YS3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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RAB11FIP4Q86YS3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB11FIP4Q86YS3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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